防潮：甘肃气候干燥，但温差较大，棉纱容易吸潮。因此，仓库应保持干燥，相对湿度应控制在60%以下。可以使用除湿机或干燥剂来降低仓库湿度。

防尘：甘肃地区风沙较大，棉纱容易吸附灰尘。应确保仓库门窗密封良好，避免风沙进入。必要时，可以使用防尘罩或防尘布。

防虫害：棉纱容易受到害虫侵害，如棉红蜘蛛等。仓库应定期检查，发现虫害及时处理，可以使用磷化氢熏蒸等方法进行防治。

防霉变：由于棉纱吸潮后容易发霉，应避免棉纱长时间暴露在潮湿环境中。储存时，可以将棉纱放在通风良好的地方，避免堆放过高。

合理堆放：棉纱堆放时，应留出足够的空间，以便于通风和检查。建议采用垛式堆放，垛底垫高，保证空气流通。

标识管理：仓库内应做好棉纱的标识管理，包括品种、规格、批号、生产日期等信息，便于查找和管理。

温度控制：棉纱储存温度应控制在15-25℃之间，避免过高或过低温度对棉纱性能的影响。

定期检查：定期对棉纱进行质量检查，发现问题及时处理，确保棉纱质量。

消防措施：仓库内应配备灭火器材，并定期检查消防设施，确保消防通道畅通。

遵守相关法规：储存有机棉纱时，应遵守国家和地方有关法律法规，确保储存安全。